Le logiciel LAMMPS est installé sur Babel.
Pour connaitre les différentes version de LAMMPS installées :
module avail lammps
Pour charger la version par défaut :
module load lammps
Pour charger une version particulière, par exemple ici lammps/2011.07.01 :
module load lammps/2011.07.01
Voici un example de fichier de soumission pour LAMMPS :
# @ job_name = LAMMPS # @ job_type = BLUEGENE # @ output = $(job_name).$(jobid) # @ error = $(output) # @ wall_clock_limit = 00:30:00 # @ bg_size = 64 # @ queue set -x cd $TMPDIR cp $LOADL_STEP_INITDIR/in.indent . module load lammps # Pour specifier le PATH de l'executable utiliser la variable d'environnement # LAMMPS_EXEDIR definie par le module via $LAMMPS_EXEDIR/lmp # Execution en mode VN sur 256 processus (bg_size*4 processus en mode VN) mpirun -mode VN -np 256 -exe $LAMMPS_EXEDIR/lmp -args "-in in.indent"