Vargas, cluster IBM de processeurs Power6

Configuration matérielle et logicielle

Environnement de calcul

• Espaces disques et quotas associés
• La commande module
• Gestion de la mémoire (zones stack et data)
• Limites en interactif et en batch : structure de classes
• Transferts de fichiers
• Contrôle d'accès via les ACL (répertoires et fichiers)
• Restauration de fichiers du HOME avec le logiciel TINA

Système de compilation Fortran

• Appel du système de compilation
• Préprocesseur
• Options principales du système de compilation
• Appel de fonctions C à partir de Fortran
• Code parallèle MPI
• Code parallèle OpenMP
• Parallélisation automatique
• Code parallèle mixte MPI/OpenMP
• Taille par défaut des enregistrements pour les fichiers séquentiels

Système de compilation C/C++

• Appel du système de compilation
• Préprocesseur
• Options principales du système de compilation
• Appel de fonctions Fortran à partir de C
• Code parallèle MPI
• Code parallèle OpenMP
• Code parallèle mixte Mpi/OpenMP

Logiciels et bibliothèques

• Les bibliothèques scientifiques
• La bibliothèque NetCDF
• La bibliothèque HDF
• La bibliothèque Parallel NetCDF
• Les entrées-sorties parallèles en MPI
• Les logiciels de chimie

Exécution/contrôle d'un code en interactif

• Limites en interactif et en batch : structure de classes
• Code séquentiel
• Code parallèle en mémoire partagée (parallélisé avec OpenMP ou automatiquement)
• Code parallèle MPI
• Code parallèle mixte MPI/OpenMP

Exécution/contrôle d'un code en batch

• Limites en batch : structure de classes
• Contrôle et suivi de vos travaux
• Code séquentiel
• Code parallèle OpenMP
• Code parallèle MPI
• Code parallèle mixte MPI/OpenMP
• Modes ST et SMT pour les exécutions parallèles
• Travaux multi-étapes et en cascade

Débogage

• Options de débogage du compilateur Fortran
• Options de débogage du compilateur C
• Outils de débogage
• Déblocage d'une communication point à point standard dans un programme MPI
• Création de fichiers core avec un programme MPI

Analyse de performances et optimisation

• Fortran : options d'optimisation
• Fortran : options d'analyse de performances
• Fonctions Fortran de mesure de temps
• C : options d'optimisation
• C : options d'analyse de performances
• Fonctions C/C++ de mesure de temps
• Mesure de temps dans un code parallèle Fortran MPI
• SCALASCA : outil graphique de profilage MPI et OpenMP
• mpiP : outil de profilage des appels MPI
• FPMPI2 : outil de profilage des appels MPI
• Analyse de performance avec HPCT
• Commande Unix de mesure de temps

Documentations IBM

© CNRS - IDRIS, 13/01/2012