Vargas : espaces disques et quotas
Le HOME
- permanent,
- sauvegardé quotidiennement par le logiciel TiNa,
- soumis au système de quotas, quota attribué à un groupe pour la durée du projet.
Ce quota est volontairement limité du fait des contraintes liées à la sauvegarde journalière (durée totale de la sauvegarde inférieure à la nuit).
Le quota par défaut est de 300 Mo par groupe dans le HOME. Par sécurité, les fichiers sont
dupliqués par le système de façon transparente pour l'utilisateur; le quota réel est donc le double de la valeur
utile (soit 600 Mo par groupe). Par conséquent, toutes les valeurs affichées par la commande quota_u
sont doublées par rapport à la situation réelle dans votre HOME.
Ce répertoire servira à stocker les fichiers de petite taille et très souvent utilisés (les sources, les
bibliothèques ou les utilitaires).
Restauration de fichiers avec le logiciel Tina.
Le WORKDIR
Le WORKDIR
est un espace :
- permanent,
- NON sauvegardé,
- non soumis à ménage,
- soumis au système de quotas permettant de délimiter
l'espace occupé par un groupe.
Le quota par défaut est de 10 Go par groupe. Cette limite
peut être augmentée sur simple demande motivée du responsable de projet sur le site extranet.idris.fr.
C'est un espace disque GPFS dont la bande passante, partagée
entre les deux machines Vargas et Babel, peut être ponctuellement saturée en cas d'utilisation
intensive.
Sa taille totale est de l'ordre de 400 To.
C'est le répertoire de travail où on stocke généralement des copies de
fichiers de travail, les exécutables, les fichiers objets, les fichiers
résultat...
Attention: cet espace n'est pas sauvegardé. Sa gestion vous incombe entièrement :
gestion des quotas, recopie des fichiers sensibles ou importants sur la machine Gaya
(contrairement à l'ancienne machine IBM Zahir ou un ménage automatique avait lieu).
La commande quota_u -w vous permet de lister l'occupation disque des différents membres de votre groupe.
Le TMPDIR
Le TMPDIR est un espace :
- temporaire,
- sa taille est de plusieurs To .
- Il est créé automatiquement sous le nom symbolique $TMPDIR
lorsqu'une session interactive ou un travail batch démarre.
- Il est vide au démarrage du travail batch; il est détruit
automatiquement à la fin de l'exécution ou de la session interactive.
De ce fait, à la fin du travail ou de la session, il faut penser
à sauvegarder les fichiers importants du TMPDIR
dans un espace disque permanent (HOME ou WORKDIR).
Nous vous conseillons d'utiliser le TMPDIR comme
répertoire d'exécution par défaut pour vos applications.
Pour un travail intra-nœud (séquentiel, OpenMP ou MPI < 32
processus), le TMPDIR est situé sur un disque local au nœud.
La bande passante est alors quasiment dédiée, elle n'est partagée que
par les travaux s'exécutant sur ce nœud. Par contre,
l'utilisateur n'a pas visibilité sur cet espace disque en cours d'exécution.
La taille de l'ensemble des TMPDIR locaux est de l'ordre de 400 To.
Pour les autres types de travaux (MPI > 32 processus),
on utilise un TMPDIR GPFS dont la bande passante,
partagée entre les deux machines Vargas et Babel, peut être ponctuellement saturée en cas
d'utilisation intensive. Par contre, l'utilisateur a la visibilité sur cet espace disque pendant l'exécution .
Sa taille totale est de l'ordre de 400 To.
Pour les travaux multi-étapes, quelque soit le type de travail
(séquentiel, OpenMP ou MPI), le TMPDIR est rémanent :
le contenu du répertoire n'est pas effacé, mais conservé entre les différentes étapes et
l'utilisateur a visibilité sur cet espace pendant l'exécution.
Remarques :
- Des recommandations concernant l'utilisation et le choix de l'espace disque
à utiliser lors d'une exécution sont disponibles dans ce
document.
© CNRS - IDRIS, 13/01/2012