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Flash Info de l'IDRIS - n° 2009-4 (09/04/2009)
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Au sommaire :
NEC SX-8
Utilisation des classes séquentielles grosses mémoires
Travaux NQS bloqués avec statut EXT
IBM Blue Gene/P
Création de nouvelles classes longues nRt3 d'une durée de 20h
Le logiciel LAMMPS version 2009.03.26 est disponible
Le logiciel NAMD version 2.7b1 est disponible
IBM power 6
Utilisation des classes mt16 et mt32
Mise en place d'une limite du nombre des travaux par utilisateur
Les classes monoprocesseur grande mémoire (tnL) passent de 14,8 à 20,5 Go
Le logiciel LAMMPS version 2009.03.26 est disponible
Attribution des ressources
La campagne d'attribution d'heures de juin est ouverte
Mise à jour des quotas sur Gaya
Le site web de l'IDRIS
Pensez à consulter la page "Message urgent" en cas de problème
Le Flash Info désormais consultable en ligne
* NEC SX-8
- Les temps d'attente dans les classes séquentielles grosses mémoires (> 10Go) ont fortement augmenté ces dernières semaines. Ces classes doivent servir à des travaux ponctuels et ne peuvent pas être destinées à une production régulière. Pour répondre à cette demande nous vous orientons vers les classes séquentielles (tnL) sur Vargas dont la taille mémoire a été augmentée à 20 Go à cette fin.
- Les travaux NQS bloqués pendant plus de deux heures en phase finale avec le status EXT sont désormais tués automatiquement :
http://www.idris.fr/su/Vectoriel/brodie/retour_job.html
* IBM Blue Gene/P
- Depuis le 7 avril dernier, de nouvelles classes longues (nRt3) d'une durée elapsed de 20h ont été ouvertes aux utilisateurs. Pour les utiliser, il suffit de coder une valeur de wall_clock_limit comprise entre 10h et 20h. Des informations complémentaires sont disponibles via la commande "news class" sur Babel.
- Le logiciel LAMMPS version 2009.03.26 est disponible :
http://www.idris.fr/su/Scalaire/babel/logiciels/lammps.html
- Le logiciel NAMD version 2.7b1 est disponible :
http://www.idris.fr/su/Scalaire/babel/logiciels/namd.html
* IBM Power6
- De plus en plus de travaux s'executant dans les classes mt16 et mt32 souffrent d'une mauvaise efficacité, parfois inférieure à 50%, ce qui correspond à un gaspillage de plus de la moitié des ressources consommées! Or, depuis le 12 janvier, ce sont ces ressources dédiées que l'IDRIS comptabilise, qu'elles soient réellement utilisées ou non. Cela explique l'augmentation soudaine de la consommation de certains utilisateurs.
En cas de problème, pour améliorer l'efficacité, nous vous conseillons :
1) de réduire le nombre de threads d'exécution,
2) d'utiliser un système de fichier local ($TMPDIR) pour les entrée-sorties et d'éviter d'avoir recours aux travaux multi-étapes lorsque cela n'est pas indispensable.
Si cela ne suffit pas à résoudre votre problème, n'hésitez pas à prendre contact avec le Support aux Utilisateurs.
La commande jar permet d'obtenir l'efficacité de vos travaux (jar -h) ou http://www.idris.fr/su/Scalaire/vargas/batch_controle.html
- Une limite de sécurité de 50 travaux en attente par utilisateur a été positionnée sur Vargas, suite à la soumission accidentelle de plusieurs milliers de travaux par un utilisateur, qui a causé un crash de LoadLeveler.
- Les classes monoprocesseur grande mémoire (tnL) passent de 14,8 à 20,5 Go. Ainsi, les jobs monoprocesseur ne présentant pas de bonnes performances sur la NEC SX-8 peuvent passer sur l'IBM. http://www.idris.fr:8079/su/Scalaire/vargas/class.html ou "news class" sur vargas.
- Le logiciel LAMMPS version 2009.03.26 est disponible :
http://www.idris.fr/su/Scalaire/vargas/logiciels/lammps.html
* Attribution des ressources
- Dans le cadre de la campagne 2009 d'attribution d'heures sur les moyens de calcul nationaux une seconde session est organisée entre le 1er avril et le 15 mai 2009. Cette session permet ainsi aux utilisateurs soit de demander une extension de leur attribution d'heures de calcul 2009 soit de déposer un nouveau dossier pour le second semestre 2009.
Nous vous invitons donc à soumettre avant le 15 mai 2009 vos demandes sur le serveur DARI (Demande d'Attribution de Ressources Informatiques) à l'adresse suivante : https://www.edari.fr
- Les demandes de quota sur la machine Gaya associées à la dernière campagne d'allocation ont été traitées et sont maintenant effectives. Utiliser la commande quota_u pour le vérifier. Si vous détectez une anomalie, contacter le Support aux Utilisateurs ().
* Le site web de l'IDRIS :
Pensez à consulter la section "Etat des machines, nouveautés" dans la rubrique "Espace utilisateurs" du site web. Vous y trouverez des informations réservées aux utilisateurs de l'IDRIS :
- les arrêts machines planifiés,
- les "news" des calculateurs de l'IDRIS,
- les archives de ce Flash Info (qui viennent d'être mises en ligne),
- les informations importantes destinées aux utilisateurs : cette zone n'est renseignée qu'en cas de besoin par l'IDRIS avec des informations concernant les arrêts non prévus ou les problèmes ponctuels sur les machines, les jours de fermetures de l'IDRIS...
www.idris.fr > Espace utilisateurs > Etat des machines, nouveautés
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