Introduction à la bibliothèque PETSc
Responsable : Serge Van Criekingen
Intervenants : Rémi Lacroix, Dimitri Lecas, Serge Van Criekingen
Objectifs
- Apprendre les bases nécessaires pour débuter avec la librairie PETSc (Portable, Extensible Toolkit for Scientific Computation)
- Se familiariser avec la documentation en ligne de PETSc
- Pouvoir construire et résoudre des exemples simples d'équations aux dérivées partielles
- Pouvoir utiliser et comparer différentes méthodes de résolution sur ces exemples, sur CPU et GPU
- Être prêt à approfondir seul les fonctionnalités de PETSc utiles à son application
- Public concerné
- Pré-requis
- Durée et modalités
- Contenu de la formation
- Supports de cours
- Prochaines sessions
Public concerné
Cette formation s'adresse à toute personne souhaitant débuter dans l'utilisation de la bibliothèque PETSc.
Pré-requis
- Connaissance de base de Linux et d'un éditeur de texte.
- Connaissance et utilisation des langages Fortran ou C.
- Notions de base d'algèbre linéaire et du standard MPI de programmation parallèle.
Durée et modalités
Cette formation dure 2 jours :
- de 09h30 à 12h30 et
- de 13h30 à 17h30.
Elle a lieu uniquement en présentiel dans les locaux de l'IDRIS à Orsay (91).
Assistance
Minimale : 8 personnes ;
Maximale : 20 personnes.
Contenu de la formation
Le cours propose une alternance de cours (~7h) et de travaux pratiques (~7h).
- Introduction : description de l'écosystème PETSc et de ses composants principaux
- Vecteurs : définition des différents types de vecteur, opérations et accès (avec notions d'efficacité)
- Matrices : définition des différents types, opérations, pré-allocation
- Solveurs : aperçu des différentes méthodes de résolution accessibles, application au cas du Laplacien bi-dimensionnel, exécution sur un noeud CPU ou GPU du supercalculateur Jean Zay
- Compléments : outils de profiling et de débogage propres à PETSc, aperçu des potentialités de gestion automatique des maillages structurés (DMDA)
Pour une exécution efficace des parties pratiques, celles-ci se dérouleront sur le supercalculateur Jean Zay. Une station de travail avec accès au calculateur de l'IDRIS est mise à disposition des apprenants. Une expérience dans l’utilisation d’un supercalculateur, tout comme un accès préalable à celui-ci, ne sont pas requis.
Support de cours
Tous les supports de cours, y compris les diapositives, les notes et les exercices pratiques, sont fournis sous la licence suivante : Creative Commons Attribution-NonCommercial-ShareAlike 4.0 International License (CC BY-NC-SA 4.0). Pour plus de détails sur la licence, veuillez consulter cette page.
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