La bibliothèque HDF5

Présentation

HDF signifie Hierarchical Data Format. Ce format a été développé par le NCSA (National Center for Supercomputing Applications) avant d'être repris par le HDF Group. Il vise à faciliter la manipulation de fichiers contenant de très grandes quantités de données en hiérarchisant ces données en arborescence.

Versions disponibles

Les versions installées sur Jean Zay ont été compilées en séquentiel et parallèle avec IntelMPI ou OpenMPI.

Utilisation

HDF5 est accessible via la commande module.

Versions séquentielles

module load hdf5/1.12.0

Versions parallèles IntelMPI

module load hdf5/1.14.5-mpi

Version parallèle OpenMPI

module load hdf5/1.14.5-mpi-cuda

Documentation

Pour plus d'information sur la bibliothèque HDF5 : http://www.hdfgroup.org/HDF5/

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Utilisation​

Versions séquentielles​

Versions parallèles IntelMPI​

Version parallèle OpenMPI​

Documentation​