
Logiciels de simulation atomistique sur Jean Zay
Cette page regroupe les logiciels de simulation atomistique installés sur Jean Zay. Ils sont principalement à destination des utilisateurs des Comités Thématiques suivants :
- CT7 : Dynamique moléculaire appliquée à la biologie
- CT8 : Chimie quantique et modélisation moléculaire
- CT9 : Physique, chimie et propriétés des matériaux
Une présentation de l'IDRIS, de GENCI et quelques conseils de bases sont disponibles dans le document suivant (01/2020).
L'ensemble des produits est disponible en version CPU.
Produits testés | Disponible sur Jean Zay avec le support GPU | Benchmark |
---|---|---|
Abinit | Oui | |
ADF/AMS | Oui | |
Amber | Oui | |
CP2K | Oui | |
CPMD | Oui | |
Crystal | Non | |
Gaussian | Oui | |
Gromacs | Oui | Benchmarks for Gromacs on Jean Zay |
LAMMPS | Non | |
OpenMOLCAS | Non | |
Molpro | Non | |
NAMD | Oui | Benchmark for NAMD on Jean Zay |
NWChem | Non | |
ORCA | Non | |
OpenMX | Non | |
Quantum Espresso | Non | |
Siesta | Non | |
VASP | Oui | VASP Benchmark on Jean Zay |
QMCpack | Oui |
Produits NON testés | Disponible sur Jean Zay avec le support GPU |
---|---|
BigDFT | Oui |
Produits en cours d'installation | |
Dalton |
Python pour la simulation atomistique
Un module regroupant les packages python dédiés à la simulation atomistique est maintenant disponible.
module load atomistic_simulation/py3
Pour connaitre les produits disponibles vous pouvez exécuter :
module help atomistic_simulation/py3