Logiciels de simulation atomistique sur Jean Zay
Cette page regroupe les logiciels de simulation atomistique installés sur Jean Zay. Ils sont principalement à destination des utilisateurs des Comités Thématiques suivants :
- CT7 : Dynamique moléculaire appliquée à la biologie
- CT8 : Chimie quantique et modélisation moléculaire
- CT9 : Physique, chimie et propriétés des matériaux
Une présentation de l'IDRIS, de GENCI et quelques conseils de bases sont disponibles dans le document suivant (01/2020).
L'ensemble des produits est disponible en version CPU.
| Produits testés | Disponible sur Jean Zay avec le support GPU | Benchmark |
|---|---|---|
| Abinit | Oui | |
| ADF/AMS | Oui | |
| Amber | Oui | |
| CP2K | Oui | |
| CPMD | Oui | |
| Crystal | Non | |
| Gaussian | Oui | |
| Gromacs | Oui | Benchmarks for Gromacs on Jean Zay |
| LAMMPS | Non | |
| OpenMOLCAS | Non | |
| Molpro | Non | |
| NAMD | Oui | Benchmark for NAMD on Jean Zay |
| NWChem | Non | |
| ORCA | Non | |
| OpenMX | Non | |
| Quantum Espresso | Non | |
| Siesta | Non | |
| VASP | Oui | VASP Benchmark on Jean Zay |
| QMCpack | Oui |
| Produits NON testés | Disponible sur Jean Zay avec le support GPU |
|---|---|
| BigDFT | Oui |
| Produits en cours d'installation | |
| Dalton |
Python pour la simulation atomistique
Un module regroupant les packages python dédiés à la simulation atomistique est maintenant disponible.
module load atomistic_simulation/py3
Pour connaitre les produits disponibles vous pouvez exécuter :
module help atomistic_simulation/py3