Logiciels de simulation atomistique sur Jean Zay

Cette page regroupe les logiciels de simulation atomistique installés sur Jean Zay. Ils sont principalement à destination des utilisateurs des Comités Thématiques suivants :

  • CT7 : Dynamique moléculaire appliquée à la biologie
  • CT8 : Chimie quantique et modélisation moléculaire
  • CT9 : Physique, chimie et propriétés des matériaux

Une présentation de l'IDRIS, de GENCI et quelques conseils de bases sont disponibles dans le document suivant (01/2020).

L'ensemble des produits est disponible en version CPU.

Produits testés Disponible sur Jean Zay avec le support GPU Benchmark
Abinit Oui
ADF Oui
Amber Oui
CP2K Oui
CPMD Oui
Crystal Non
Gaussian Oui
Gromacs Oui Benchmarks for Gromacs on Jean Zay
LAMMPS Non
OpenMOLCAS Non
Molpro Non
NAMD Oui Benchmark for NAMD on Jean Zay
NWChem Non
ORCA Non
OpenMX Non
Quantum Espresso Non
Siesta Non
VASP Oui VASP Benchmark on Jean Zay
QMCpack Oui
Produits NON testés Disponible sur Jean Zay avec le support GPU
BigDFT Oui
Produits en cours d'installation
Dalton

Python pour la simulation atomistique

Un module regroupant les packages python dédiés à la simulation atomistique est maintenant disponible.

module load atomistic_simulation/py3

Pour connaitre les produits disponibles vous pouvez exécuter :

module help atomistic_simulation/py3