Jean Zay : la bibliothèque BLAS

BLAS (Basic Linear Algebra Subprograms) est un ensemble de fonctions réalisant des opérations de base de l'algèbre linéaire comme des additions de vecteurs, des produits scalaires ou des multiplications de matrices.

BLAS est disponible via les bibliothèques Intel MKL (Math Kernel Libraries) que nous recommandons car elles offrent de meilleures performances ou en versions libres (Netlib et OpenBLAS).

• Versions Intel MKL (versions recommandées)
• netlib-lapack/3.8.0 : LAPACK 3.8.0, compilateurs GCC 8.2.0, GCC 9.1.0 ou Intel 2019.4
• openblas/0.3.6 : OpenBLAS 0.3.6, compilateurs GCC 8.2.0, GCC 9.1.0 ou Intel 2019.4

Ces informations peuvent être retrouvées par les commandes :

$ module avail intel-mkl
$ module avail netlib-lapack
$ module avail openblas

Les versions de BLAS sont disponibles dans les environnements suivants :

• Les environnements Intel relatifs aux diverses Intel MKL
• intel-compilers/19.0.4
• gcc/9.1.0
• gcc/8.2.0

Concernant les environnements Intel, nous vous invitons à consulter notre documentation sur les bibliothèques Intel MKL.

Pour les versions libres, ces informations peuvent être retrouvées par les commandes :

$ module show netlib-lapack
$ module show openblas

Pour utiliser cette librairie dans d'autres environnements, veuillez contacter l'équipe Support aux Utilisateurs.

Remarque : pour obtenir les informations sur les chemins d'accès aux librairies des versions libres, il sera nécessaire de charger au préalable l'environnement choisi (Gcc dans cet exemple) :

$ module load gcc/9.1.0
$ module show netlib-lapack
$ module show openblas

La bibliothèque est accessible par module.

Pour l'utilisation de la MKL, nous vous invitons à consulter la page concernant les bibliothèques Intel MKL.

Pour l'utilisation de la bibliothèque LAPACK, nous vous invitons à consulter notre documentation concernant les bibliothèques LAPACK.

Pour charger la version par défaut dans l'environnement courant ou dans l'environnement par défaut si aucun environnement n'est préalablement chargé :

$ module load openblas

ou pour charger une version spécifique dans un environnement spécifique (Gcc dans cet exemple) :

$ module load gcc/8.2.0
$ module load openblas/0.3.6

Nous vous invitons à consulter la page concernant les bibliothèques Intel MKL.

L'édition des liens pour l'utilisation de la MKL peut varier en fonction de plusieurs paramètres tels que le système d'exploitation, le type de compilateur et l'architecture. Il est recommandé d'utiliser Intel® Math Kernel Library Link Line Advisor pour retrouver les options appropriées.

Voici un exemple pour la bibliothèque BLAS :

$ module load intel-mkl
$ ifort appel_blas.f90 -L${MKLROOT}/lib/intel64 -lmkl_intel_lp64 -lmkl_sequential \
                       -lmkl_core -lpthread -lm -ldl

Pour l'édition de liens avec la bibliothèque libre LAPACK, nous vous invitons à consulter notre documentation concernant les bibliothèques LAPACK.

Lors de l'édition de liens, il est nécessaire d'ajouter les options -lblas :

$ module load gcc/9.1.0
$ module load netlib-lapack
$ gfortran appel_blas.f90 -lblas

Lors de l'édition de liens, il est nécessaire d'ajouter les options -lopenblas :

$ module load gcc/9.1.0
$ module load openblas
$ gfortran appel_blas.f90 -lopenblas

Site de référence (Netlib)
Site de référence (OpenBLAS)
Intel MKL documentation
Intel MKL Link Line Advisor