Les logiciels de chimie à l'IDRIS

Logiciels de simulation atomistiques sur Jean Zay

La liste des logiciels installés sur Jean Zay est disponible sur la page dédiée.

Logiciels de simulation atomistiques sur Ada et Turing

Présentations lors de la journée sur les logiciels de chimie à l'IDRIS :

  • Fascicule de la journée 2014 : PDF
  • Fascicule de la journée 2013 : PDF
  • Memo pratique d'utilisation des ressources de l'IDRIS : PDF
  • Présentation du CT7 : PDF
  • Présentation du CT8 : PDF
  • Présentation du CT9 : PDF

Le tableau suivant donne la version installée pour chaque logiciel et chaque machine de l'IDRIS.

Logiciel Ada
      (IBM X3750)      
Turing
 (IBM Blue Gene/Q) 
Type de calcul
ABINIT 8.8.4
8.2.2
7.10.4
7.6.2
7.4.1
7.0.5
7.10.4
7.4.1
Chimie quantique ab initio (DFT).
ADF 2017.106
2016.101
2014.05
2013.01c
2012.01c
Chimie quantique ab initio (DFT).
BigDFT 1.7-dev.28 1.7-dev.28 Chimie quantique ab initio (DFT), avec formalisme d'ondelettes.
CP2K 5.1
3.0
2.6.0
2.5.1_13632
2.4.0_12993
2.4_12578
2.3_12343
3.0
2.6.0
2.5.1_13632
2.4.0_12993
2.3_12343
Simulations moléculaires et atomiques ab initio.
CPMD 4.1
3.17.1
3.15.3
3.13.2
4.1
3.17.1
3.15.3
3.13.2
Car-Parrinello Molecular Dynamics. Dynamique moléculaire et structure électronique ab initio.
Crystal 17 v1.0.2
17 v1.0.1
14 v1.0.3
14 v1.0.2
09 v2.0.1
14 v1.0.3
14 v1.0.2
09 v2.0.1
Chimie quantique ab initio (systèmes périodiques).
Gaussian 09 rev. D01
09 rev. C01
09 rev. A02
03 rev. D02
Chimie quantique ab initio.
GROMACS 2016.3
5.1.4
5.0.2
5.0.1
4.6.5
4.6.3
2016.5
5.1.4
5.1.2
5.0.7
5.0.2
5.0.1
4.6.5
4.5.5
Code de dynamique moléculaire.
LAMMPS 2017.03.31
01 February 2014
10 October 2012
22 August 2018
17 February 2016
09 December 2014
01 February 2014
10 October 2012
Code de dynamique moléculaire.
Molcas 8.0
7.8
Chimie quantique ab initio.
Molpro 2015.1
2012.1
2010.1
Chimie quantique ab initio.
NAMD 2.10
2.9
2.8
2.10
2.9
2.8
Code de dynamique moléculaire, notamment pour les biomolécules.
NWChem 6.6
6.3
6.1.1
6.3 Northwest Computational Chemistry Package. Logiciel de calcul ab initio.
Quantum ESPRESSO 6.0.0
5.4.0
5.3.0
5.1.0
5.0.2
5.0.1
5.4.0
5.3.0
5.1.0
5.0.2
5.0.1
Logiciel de calcul ab initio.
Siesta 4.0
3.2
3.1
2.0.2
Logiciel de calcul ab initio, avec base d'orbitales numériques (NAO).
VASP 5.4.1
5.3.5
5.2.12
5.2.2
4.6.35
5.4.1
5.3.5
5.3.3
Chimie quantique ab initio.
Yambo 4.2.1 Chimie quantique ab initio.

Pour des problèmes d'utilisation des logiciels de chimie, contactez l'assistance aux utilisateurs de l'IDRIS.

Si vous disposez d'un logiciel ou d'une version spécifique d'un logiciel que vous souhaitez porter à l'IDRIS dans le cadre de votre projet, vous pouvez nous contacter à l'assistance.

Si votre demande sort du cadre de vos besoins personnels (ou de ceux de votre projet), que vous souhaitiez que l'IDRIS prenne en charge l'installation, la maintenance, la documentation et la mise à disposition d'un logiciel (avec ou sans license payante), vous pouvez en faire la demande à l'assistance en prenant soin de rassembler auparavant une communauté d'utilisateurs significative au nom de laquelle vous ferez votre demande. Dans le cas où votre demande serait rejetée, nous pourrions toujours vous assister pour le portage du logiciel dans le cadre de votre projet.

Outils de visualisation

Les outils de visualisation sont installés sur la machine de pré/post-traitement Adapp.

Logiciel Version
VESTA 3.1.7

Liens utiles en informatique appliquée à la chimie